Il 28 marzo 2002 veniva prodotta al Ministero delle Politiche Agricole e Forestali formale istanza mirante ad ottenere il predetto marchio; Il 28 settembre 2004 veniva accordata dal citato Ministero la protezione a titolo transitorio a livello nazionale alla denominazione "pane di Matera" per la quale veniva inviata istanza alla Commissione Europea per la registrazione come IGP.

Il 5 ottobre 2005 veniva approvato il disciplinare di produzione del "Pane di Matera" e il 9 giugno 2007 sulla Gazzetta Ufficiale dell'Unione Europea andava il riconoscimento del marchio in via provvisoria; trascorsi sei mesi da quella data e non intervenuti ulteriori elementi, è arrivato il riconoscimento definitivo da parte della Commissione Europea il 22 febbraio 2008.